Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lamp1P11438 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp1P11438 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms