Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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