Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeflP08551 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NeflP08551 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NeflP08551 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeflP08551 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeflP08551 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeflP08551 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeflP08551 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeflP08551 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeflP08551 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms