Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms