Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgamP05555 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms