Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53P02340 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53P02340 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53P02340 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms