Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HbaP01942 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HbaP01942 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HbaP01942 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HbaP01942 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HbaP01942 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HbaP01942 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HbaP01942 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms