Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01669 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01669 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01669 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01669 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms