Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01667 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01667 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01667 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01667 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01667 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01667 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01667 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01667 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms