Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnkO88874 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcnkO88874 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcnkO88874 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnkO88874 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnkO88874 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnkO88874 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnkO88874 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnkO88874 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnkO88874 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnkO88874 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnkO88874 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms