Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt1O88346 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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