Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx2O70340 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx2O70340 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms