Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms