Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap18O55128 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap18O55128 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap18O55128 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap18O55128 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap18O55128 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap18O55128 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap18O55128 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms