Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap2O55126 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms