Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg2O55111 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms