Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FxnO35943 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FxnO35943 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FxnO35943 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FxnO35943 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FxnO35943 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FxnO35943 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FxnO35943 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FxnO35943 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FxnO35943 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FxnO35943 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms