Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm44O35857 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm44O35857 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms