Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Klf9O35739 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Klf9O35739 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Klf9O35739 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Klf9O35739 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Klf9O35739 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms