Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn1mwO35599 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms