Protein–RNA interactions for Protein: O08852

Pkd1, Polycystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 4,293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1O08852 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkd1O08852 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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