Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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