Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms