Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms