Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms