Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21897J3KMP5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21897J3KMP5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms