Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp408H7BX78 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp408H7BX78 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp408H7BX78 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp408H7BX78 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp408H7BX78 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp408H7BX78 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp408H7BX78 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms