Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn20G5E8X0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn20G5E8X0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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