Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pcf11G3X9Z4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms