Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms