Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms