Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms