Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms