Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2237E9Q501 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2237E9Q501 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms