Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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