Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms