Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms