Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Lrp3E9Q1T6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Lrp3E9Q1T6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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