Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms