Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms