Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms