Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc62E9PVD1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms