Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc17E9PVB5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc17E9PVB5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms