Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgaE9PV24 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgaE9PV24 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms