Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga1E1U8D0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms