Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms