Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms