Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms