Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700018F24RikB2RW27 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms