Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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